課程資訊
課程名稱
生物晶片操作與資料分析
Microarray Experiment and Data Analysis 
開課學期
105-2 
授課對象
生物資源暨農學院  生物科技研究所  
授課教師
蔡孟勳 
課號
Biot5006 
課程識別碼
642EU0080 
班次
 
學分
3.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
生技所415 
備註
本課程以英語授課。
限學士班三年級以上
總人數上限:15人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1052Biot5006_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

1.基本分子生物實驗的操作,包含細菌培養,DNA分離,電泳分析以及PCR.
2.基因晶片備製過程學習
3.細胞培養及RNA的提取
4.基因晶片的螢光標記和雜交反應
5.基因晶片的螢光掃描以及影像分析
6.建立基因晶片數據資料庫
7.利用高階軟體進行基因晶片結果之分析判讀以及推論實驗結果在生物上的意義 

課程目標
使學生對於基因晶片的備製,應用及結果之分析有實際操作和深切的認識,進而啟發學生在此一新興跨領域的學習與研究。 
課程要求
一、成績評量方式:
1.出席及課堂表現 10%
2.實驗報告 50 %
3.期末考 40%

二、預修課程:
生物晶片技術概論 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
教科書: DNA Microarrays :A Molecular Cloning Manual
David Bowtell and Joseph Sambrook
Cold Spring Harbor Laboratory Press 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/23  Overview 
第2週
3/02  Generation of Targets for Spotted Microarrays 
第3週
3/09  Generation of Targets for Spotted Microarrays 
第4週
3/16  Generation of Targets for Spotted Microarrays 
第5週
3/23  Printing Spotted Glass Microarrays 
第6週
3/30  Printing Spotted Glass Microarrays 
第7週
4/06  [Conference] No Class 
第8週
4/13  Expression Analysis of RNA 
第9週
4/20  [Midterm] No Class 
第10週
4/27  Expression Analysis of RNA 
第11週
5/04  Microarray labelling and hybridization 
第12週
5/11  Expression Analysis of RNA 
第13週
5/18  Affymetrix and Illumina microarray introduction 
第14週
5/25  Microarray Bioinformatics
 
第15週
6/01  Microarray Bioinformatics
 
第16週
6/08  Microarray Bioinformatics 
第17週
6/15  Final Exam